產品描述
單細胞ATAC測序(scATAC-seq)是基于10x genomics平臺的微流控和油滴包裹技術,在單細胞水平對細胞染色質開放區域進行檢測的新技術,可用于繪制細胞染色質開放區的單細胞圖譜,是一種高分辨率研究染色質開放程度與DNA結合蛋白調控基因的表達網絡,在單細胞水平研究表觀遺傳學的有效手段。
染色質可及性的早期研究技術是ATAC-seq(Assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing),該技術可進行高通量測序的染色質可及性(開放性)研究。10x Genomics 推出的 Chromium 單細胞 ATAC 解決方案提供了一種全面的、可擴展的方法來研究分析單個樣本中成百上千個細胞中染色質的開放情況。可在單細胞水平進行多組學聯合分析,深度挖掘細胞異質性表觀遺傳調控機理。
產品優勢
高通量的細胞捕獲,適用于細胞系、原代細胞、新鮮組織和凍存樣本的研究;
單細胞水平揭示細胞核內染色質可接近性的差異;
鑒定細胞類型特異的轉錄因子,深入研究轉錄調控網絡;
技術重復性強、成功率高;
實驗流程
樣本類型 | 建議送樣量 | 存儲介質 | 保存、運輸條件 |
凍存細胞 | >20 w | 1.將細胞重懸與凍存液(50% FBS+40%完全培養基+10% DMSO)中,每個凍存管加入≥20萬細胞 2.將凍存管(標記樣本名)放入程序降溫盒中,放入-80度冰箱,降溫6-24H后即可準備運輸 | -80℃冰箱保存,干冰運輸 |
新鮮細胞 | >10 w | 10%FBS常用培養基 | 運輸時使用碎冰4°運送,新鮮細胞懸液盡可能在4h內送達 |
動物組織 | >30 mg | / | 液氮速凍30min 后放于-80℃保存;干冰運輸 |
植物 | 葉片≥0.5g;莖≥1 g;根≥1 g | / | 液氮速凍樣本,然后用預冷的錫箔紙包裹儲存在-80°C,干冰運輸 |
研究方向/思路