產品描述
DNA甲基化在基因表達調控中扮演著重要的角色，參與生物體多種重要的生命活動。DNA甲基化異常及其對基因表達的影響會導致人類的許多復雜疾病的發生，如癌癥、神經疾病和糖尿病等。為了研究甲基化在人體內的重要作用，Illumina推出了新一代的甲基化芯片Infinium Methy lationEPIC v2.0 BeadChip（簡稱935k芯片）。
935K芯片可檢測人全基因組超過 935,000 個 CpG 位點的甲基化狀態，去除了 EPICV1.0 性能不佳的探針,新增的 186,000 個 CpG 靶向增強子和超級增強子、更多 CTCF 結合位點、CNV 檢測區域、EPIC v1.0 覆蓋不足的CpG 島以及常見 癌癥驅動突變，是更適合于表觀基因組全關聯分析研究（EWAS）的一款芯片。
935k結題報告為壓縮包，包括結果圖表和網頁版結題報告。網頁報告可打開文件夾中index.html文件。主要結果主要包括三部分內容：原始數據預處理和標準化，差異甲基化位點分析及差異甲基化區域分析。其中最重要的是差異甲基化位點分析(Methy lation_Variable_Positions)，需要重點關注差異甲基化位點及其關聯基因，找到關鍵的調控因子。
產品優勢
1、全面的基因組覆蓋范圍：檢測> 935,000個CpG位點，全面覆蓋CpG島、啟動子、編碼區及增強子全基因組分析，無需預先設計特異性探針能夠檢測未知基因；
2、分辨率高：單堿基分辨率，可以直接檢測到發生甲基化的準確位點；
3、可重復性高：自身技術重復間的相關性以及與850K相同探針間的相關性R2 > 0.995；
4、 高質量的數據，沿用了450k芯片的Infinium技術，同時采用Infinium I及II探針設計，使檢測范圍最大化；
實驗流程
數據分析
| 樣本類型 | 建議送樣量 | 保存、運輸介質 |
| 組織 | ＞50mg | -80℃保存，干冰運輸 |
| 細胞 | ＞2 x 10^6 | -80℃保存，干冰運輸 |
| 血液 | ＞1ml | -80℃保存，干冰/4度（新鮮）運輸 |
| FFPE | A.切片組織面積大于1cm2，切片表面無劃痕，無干裂，均勻貼片的石蠟切片； B.切片組織細胞>30000個；有核細胞比例>80%；腫瘤細胞比例>20%，白片厚度5~ 10um，需3-5片，組織面積偏小或細胞核占比未達80%以上，需提供5-12片； C.石蠟塊：厚度4mm以上，組織約綠豆大小以上； D.蠟卷：厚度25um左右，2-5卷 | 4℃或常溫保存和運輸 |
| gDNA | ＞1ug | -80℃保存，干冰運輸 |
研究方向/思路
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