單細胞ATAC測序簡介
染色質轉座酶可及性測序(ATAC-Seq)是確定全基因組范圍內的染色質可及性的常 用方法。 ATAC-Seq可以對開放的染色質區域進行測序,并以此來了解染色質包裝和其他因素如何影響基因的表達。
實驗原理
進行ATAC-Seq時,基因組DNA會暴露在高 活性轉座酶Tn5中。 Tn5會優先插入到開放染 色質位點,使DNA片段化,并同時添加測序 引物(該過程名為轉座酶片段化)。測序的 DNA即代表開放的染色質,可通過數據分析 深入了解基因調控。此外, ATAC-Seq還可 以與RNA測序等其他方法相結合,作為多組 學方法來研究基因的表達
實驗流程
數據性能
1.敏感性和特異性高
2.重現性高