1. 空間位置標記 Visium HD的空間基因表達芯片有2個捕獲區。每個捕獲區域為6.5x6.5mm。捕獲區有~1100萬個基因表達spot點,每個點包括標記空間位置的Spatial Barcode,以追溯RNA來源位置信息。
2. 全基因組探針捕獲 同單細胞Fixed RNA方案,Visium HD空轉也使用全基因組探針靶向雜交捕獲的方式,探針由左右臂組成,只有左右臂同時靶定目的區域才能進行連接被膠珠上的Poly(dT)VN捕獲。
基于以上兩點,單鏈連接產物在RNase處理和透化后從組織中釋放出來,然后在空轉載玻片上被捕獲。一旦連接產物被捕獲,探針經過延伸后被添加上UMI、Spatial Barcode和Read1T。最終生成帶有空間條形碼的探針產物,繼續用于測序文庫的制備。
注意事項 暫時僅可支持人和小鼠,若需要做其他物種,可聯系我們做新鮮速凍組織空轉(一代)。
實驗流程
研究方向
分析流程
分析結果展示